振动分析审稿意见求助

Markmahao · 发表于 Post on 2020-5-3 17:52:51

各位老师好，有一条审稿意见是这样：“There are more advanced ways to assign spectra theoretically (anharmonicfrequency analysis a la B. Gereber and Baroni (the latter being implemented inGaussian 09, as well as AIMD-based Raman simulations)” 我能理解审稿人觉得用校正因子不做anharmonic frequency analysis对于我的实验体系有点对付，AIMD-based Raman simulations的优势在哪呢？在高斯中如何实现？烦请各位老师指点一下修改方式，谢谢

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2020-5-3 21:07:44

提俩巨贵的计算方法。。。你的分子非常小么？

Markmahao · 发表于 Post on 2020-5-4 08:48:45

liyuanhe211 发表于 2020-5-3 21:07
提俩巨贵的计算方法。。。你的分子非常小么？

谢谢您的回复。是的，不太大，我现在的想法是完成其中一种，但对AIMD-based Raman simulations没经验，也不懂它的优势在哪。

wuzhiyi · 发表于 Post on 2020-5-4 22:40:03

本帖最后由 wuzhiyi 于 2020-5-4 22:42 编辑

anharmonic frequency analysis等于就是在最低点求多阶导数，好处是不需要采样，不存在收敛问题，坏处就是如果势能面比较古怪，根据多阶导数展开的势能面就不一定是真的势能面。
AIMD的话，就等于直接再势能面上采样，采样出来的结果就是真实的势能面，坏处就是如果采样的不足，势能面就会根据采样的时长变化，必须得采样到势能面不随时长变化才可以说结果收敛了。

sobereva · 发表于 Post on 2020-5-5 07:50:55

直接用Gaussian的GVPT2非谐振就完了，省事得多，用AIMD往往结果还不如GVPT2。
做AIMD耗时非常高，如果没有经验也没有很好的机子，根本别指望。

一个AIMD模拟得到振动光谱的例子见J. Phys. Chem. B, 120, 1429 (2016)，峰位置还不如省事便宜得多的GVPT2的好。下图NMA是谐振近似下的结果

Markmahao · 发表于 Post on 2020-5-5 10:21:18

sobereva 发表于 2020-5-5 07:50
直接用Gaussian的GVPT2非谐振就完了，省事得多，用AIMD往往结果还不如GVPT2。
做AIMD耗时非常高，如果没有 ...

现在知道该怎么做了，谢谢sob老师。

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