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[VMD] 这种层次有区分的图在VMD中怎么画?

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请教下,用VMD怎么画出来这种有重点分子突出显示的图

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发表于 Post on 2020-5-25 11:33:01 | 只看该作者 Only view this author
你看看是不是这里面的
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407http://bbs.keinsci.com/thread-9472-1-1.html)中的:  5 实例:考察Actos四聚体中的相互作用

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truffle

3#
发表于 Post on 2020-5-25 12:02:06 | 只看该作者 Only view this author
前面分子用cpk,后面用licorice,调depth cueing的due density把后面弄得更糊。
No problem is insoluble in all conceivable circumstances.

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 15:11:07 | 只看该作者 Only view this author
Peter_zhong 发表于 2020-5-25 11:33
你看看是不是这里面的
通过独立梯度模型(IGM)考察分子间弱相互作用
http://sobereva.com/407(http://bbs ...

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 15:11:11 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2020-5-25 12:02
前面分子用cpk,后面用licorice,调depth cueing的due density把后面弄得更糊。

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-25 15:26:39 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2020-5-25 12:02
前面分子用cpk,后面用licorice,调depth cueing的due density把后面弄得更糊。

请教下哈, 用VMD做视频,做出来的视频如何在每帧加上步数?就是最后视频里怎么显示出来跑了多少步了?

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发表于 Post on 2020-5-26 07:45:49 | 只看该作者 Only view this author
413 发表于 2020-5-25 15:26
请教下哈, 用VMD做视频,做出来的视频如何在每帧加上步数?就是最后视频里怎么显示出来跑了多少步了?

使VMD播放轨迹时同步显示帧号
http://sobereva.com/13
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2020-5-26 07:46:19 | 只看该作者 Only view this author
后面的不仅是licorice,还要用transparent材质
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 08:54:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-5-26 07:45
使VMD播放轨迹时同步显示帧号
http://sobereva.com/13

谢谢谢谢

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