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[波函数分析求助] 求助吡啶阳离子的N上接不同取代基时的电荷分布问题

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最近在做吡啶阳离子的上N接不同取代基的电荷分布情况,按理说碳链越长给电子能力越强,N上的电荷应该更小,但是用乙基和丙基上去的时候发现接乙基的吡啶N上电荷更小,看文献有提到会是二面角的原因,但自己也一知半解的,有没有大神知道是什么情况

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发表于 Post on 2022-3-7 22:06:08 | 只看该作者 Only view this author
先把当前计算级别和计算原子电荷的方法说清楚
看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml)了解不同原子电荷计算方法的差异
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-8 08:38:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-7 22:06
先把当前计算级别和计算原子电荷的方法说清楚
看《原子电荷计算方法的对比》(http://www.whxb.pku.edu.cn ...

sob老师我是先在b3lyp/6-31++(d,p) scrf=(smd,solvent=water) em=gd3bj 下先对结构进行了优化;
然后用mk方法计算的电荷,这是我计算电荷用的# b3lyp/6-31++(d,p) scrf=(smd,solvent=water) pop=mk em=gd3bj iop(6/42=6),体系带一个正电荷;
还有sob老师我看网上说gaussian默认用的是Mulliken方法计算的电荷,但是我看结构优化的输出文件中的电荷分布与我第二步用mk方法算的电荷分布一致,也不知道是哪里出了问题

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发表于 Post on 2022-3-8 09:05:59 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai1 发表于 2022-3-8 08:38
sob老师我是先在b3lyp/6-31++(d,p) scrf=(smd,solvent=water) em=gd3bj 下先对结构进行了优化;
然后用m ...

两种电荷都输出,取哪个自己决定
带弥散函数时候Mulliken电荷没有任何意义,前述的《原子电荷计算方法的对比》一文已经明确说了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-8 10:08:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-8 09:05
两种电荷都输出,取哪个自己决定
带弥散函数时候Mulliken电荷没有任何意义,前述的《原子电荷计算方法的 ...

但是sob老师,我用mk和mulliken算出来的电荷,跟碳链越长给电子能力越强这一结论相违背了,3个碳的N上电荷反而高,我试了把弥散函数去掉,但是计算出来N上电荷变负值了

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发表于 Post on 2022-3-9 05:15:52 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai1 发表于 2022-3-8 10:08
但是sob老师,我用mk和mulliken算出来的电荷,跟碳链越长给电子能力越强这一结论相违背了,3个碳的N上电 ...

N的原子电荷为负再正常不过,本来电负性就比周围的碳要大

“碳链越长给电子能力越强”这种说法并非什么时候都适用
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