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[Gaussian/gview] 求助:高斯可不可以加电场跑动力学

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Sob老师及各位大佬们:
近期一篇实验文章(https://doi.org/10.1038/s41467-019-09120-1),通过光照或者是电场,可以使得分子构型发生变化,从Trans形态变成Cis形态,想请问各位老师,如何在高斯中加入电场,并做动力学模拟,可以使分子发生构型变化。PS:(如果不跑动力学只opt的话,输入文件写成#p opt b3lyp/6-31g(d) nosymm field=read, 坐标最后面加上电场方向0.001 0.0000 0.0000,跑出来的结构几乎没有什么变化。)
谢谢!

Side-group chemical gating via reversible opti.jpg (226.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 92)

光开关分子

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发表于 Post on 2019-5-15 17:02:03 | 只看该作者 Only view this author
你加的电场太小,结构变化体现不出来
这里给个例子

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-15 17:07:58 | 只看该作者 Only view this author
谢谢Sob老师,我再增大一下

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发表于 Post on 2020-6-4 16:19:57 | 只看该作者 Only view this author
老师请教下,我在0.025a.u.的电场强度下优化分子结构,结果不收敛。gaussview观察最后出来的结果发现有甲基和氢原子脱离了分子。
关键词#p opt b3lyp/6-31g(d) nosymm field=read
1.是否可以认为分子在这种电场强度下难以保持稳定?
2.如果用ADMP加电场跑动力学是否可以预测电场下材料的稳定性和可能的分解机理?
3.电场下的动力学什么泛函基组比较合适呢?目标分子式分子量700左右的含C,H,N的有机物

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发表于 Post on 2020-6-4 17:47:24 | 只看该作者 Only view this author
wuyiyyyy 发表于 2020-6-4 16:19
老师请教下,我在0.025a.u.的电场强度下优化分子结构,结果不收敛。gaussview观察最后出来的结果发现有甲基 ...



可能可以

和平时一样,基组上没有特殊考虑
量化计算要说就说原子数,不要说原子量,这没有意义
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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