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[Multiwfn使用咨询] 求助cda分析报错原子顺序不一致

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各位老师好,我在计算cda的时候,从整个分子的单点输入文件中取出的片段坐标,没有更改原子顺序和坐标,但是将fchk文件拖入multiwfn的时候无法计算,检查了输入文件发现坐标也没有变
输入文件已上传附件,# scrf=(solvent=toluene,read) def2tzvp int=ultrafine m06
报错如下:
请问如何解决这个问题

cda报错.png (9.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

cda报错.png

part-b.gjf

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part-a.gjf

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all.gjf

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发表于 Post on 2020-6-12 09:25:58 | 只看该作者 Only view this author
先把NoSymmetry加上再说。即使是C1点群Gaussian也会进行平移旋转导致坐标不对应。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-12 11:39:51 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-6-12 09:25
先把NoSymmetry加上再说。即使是C1点群Gaussian也会进行平移旋转导致坐标不对应。

谢谢您,我试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-12 18:13:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 namanana 于 2020-6-12 18:15 编辑
snljty 发表于 2020-6-12 09:25
先把NoSymmetry加上再说。即使是C1点群Gaussian也会进行平移旋转导致坐标不对应。

加上nosymmetry和nosymm,还是报相同的错误。有没有其他解决办法呢?

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发表于 Post on 2020-6-12 22:05:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2020-6-12 22:07 编辑

原子顺序并不一致。仔细看手册里面的描述。
The atomic sequence in fragments and complex must be identical, that means the atomic sequence in the complex can be retrieved by successively combining the atoms in fragment 1, 2, 3 ... n.


假如片段a的原子是A,B,C,D;片段b是E,F,G,H,那么总体系必须是A,B,C,D,E,F,G,H。你的文件不满足这个条件。

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发表于 Post on 2020-6-12 23:23:54 | 只看该作者 Only view this author
屏幕上的提示已经说得很明确了

在此文里我也都用红字特别强调了
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166
坐标必须都用笛卡尔坐标,而且片段的定义顺序必须和复合物中的完全一致。比如复合物文件中片段的出现顺序是A,B,C,那么就必须将A,B,C分别定义为片段1,2,3,而不能定义为诸如2,1,3。并且片段内原子顺序、原子坐标也要完全和复合物中的一致。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-17 17:40:13 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2020-6-12 22:05
原子顺序并不一致。仔细看手册里面的描述。

谢谢您,按照这个方法对坐标重新排序问题解决了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-17 17:41:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-12 23:23
屏幕上的提示已经说得很明确了

在此文里我也都用红字特别强调了

嗯嗯,是我开始没有理解

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