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[GROMACS] 构建石墨烯的top老是报错不能发现原子的力场

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本帖最后由 邱美佳 于 2020-6-27 09:01 编辑

请问为什么我在构建石墨烯的top老是报错呢?明明n2t还有ffbond,ffnobond这几个文件我都指定了呀?附件是我的n2t,ffnobond,ffbond和gro,  我创建top的命令是这样的:g _x2top -graphene.gro -o graphene.top -ff oplsaa -pbc -name graphene -kb 400000 -kt 600 -kp 150,运行之后老是出现这个错误

报错.png (77.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

报错.png

ffbonded.itp

215.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

在第一行添加了

ffnonbonded.itp

61.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

在原子类型最后一行添加了opls_966的原子类型

graphene.n2t

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graphene.gro

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发表于 Post on 2020-6-27 17:27:57 | 只看该作者 Only view this author
仔细效仿这个
使用Gromacs模拟碳纳米管的一个简单例子
http://sobereva.com/268http://bbs.keinsci.com/thread-454-1-1.html
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