求助，一个结构的分解路径和过渡态的计算流程

楚瑶 · 发表于 Post on 2024-3-11 09:56:49

各位老师好，
我现在想计算一个分子（如RDX黑索金）在一个新的催化剂结构下的分解路径，并且计算催化分解中每一个基元反应中的中间过渡态。
我的问题是，这种体系我只知道初始结构，不知道中间过渡态或者每一次基元反应的产物结构，那应该怎么进行计算呢
我不是学化学出身的，所以对一些基本的流程概念都不是很熟悉，我想的是，首先用cp2k跑AIMD，然后对轨迹文件进行分析，看它一个分子分解的时候具体是哪一个键先断裂或者形成，然后去拿这个过程的产物当作一个中间态，用NEB或者CI-NEB方法去找过渡态，不知道这个流程是不是正常的呢。
谢谢各位老师

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-12 09:58:05

可以这么做

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