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[Amber] 求助amber pmemd.cuda运行失败

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运行amber的时候,出现这样的错误,这是为啥呢,谢谢 (pmemd.cuda)



|            CUDA_VISIBLE_DEVICES: 0
|   CUDA Capable Devices Detected:      1
|           CUDA Device ID in use:      0
|                CUDA Device Name: Tesla V100-SXM2-32GB
|     CUDA Device Global Mem Size:  32480 MB
| CUDA Device Num Multiprocessors:     80
|           CUDA Device Core Freq:   1.53 GHz
|
|--------------------------------------------------------


| Conditional Compilation Defines Used:
| PUBFFT
| BINTRAJ
| CUDA
| EMIL

| Largest sphere to fit in unit cell has radius =    26.797



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发表于 Post on 2020-7-2 20:51:18 | 只看该作者 Only view this author
你有一个原子的半径有26A
检查tleap时候的原子参数信息,然后重新tleap
上海交通大学计算化学与分子生物信息学实验室
Shanghai JiaoTong University
Computational Chemistry and Molecular Bioinformatics Laboratory

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-2 23:01:03 | 只看该作者 Only view this author
DoubeeTwT 发表于 2020-7-2 20:51
你有一个原子的半径有26A
检查tleap时候的原子参数信息,然后重新tleap

不是的,在其他服务器可以正常运行;我也试了其他的体系,结果也是这个问题。

这次是在学校超算中心安装的,才有此错误,不知道原因在哪。我输入make test 发现都是ignored,没有提示错误,我估计安装的有问题,但是提示安装成功。

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