对于双路CPU服务器，如何将一个并行任务指定在特定CPU上运行

questionx · 发表于 Post on 2020-7-17 13:41:36

本帖最后由 questionx 于 2020-7-17 13:51 编辑

大家好，小弟做理论计算工作也有一阵子了，最近使用双路CPU服务器时，产生了一个疑问。如双路8173M机器，有56物理核，如果我在上面进行一个28核的并行计算任务。如何限定这28核的任务只在某一指定CPU上运行呢，如CPU0？

目前多次提交计算任务发现，CPU核心的分配好像是没有规律的，各进程随机分布在CPU0和CPU1上面，如下图所示。

如果一个计算任务的进程在两颗CPU上同时进行或来回切换，会不会因为CPU间的通信，对计算速度造成影响？

rabbitkiller · 发表于 Post on 2020-7-17 15:45:15

可以参看社长的文章

http://bbs.keinsci.com/thread-17751-1-1.html

beowulf · 发表于 Post on 2020-7-17 16:37:18

很多的mpi实现都可以绑定。

对于openmp任务，可以装一个小软件叫做
likwid，非常好用。likwid = likely I know what I am doing

bobosiji · 发表于 Post on 2020-7-17 20:35:21

mdrun -pin on -pinoffset xx 行不？

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-18 10:20:27

bobosiji 发表于 2020-7-17 20:35
mdrun -pin on -pinoffset xx 行不？

这是gmx特有的做法

abin · 发表于 Post on 2020-7-18 12:04:07

mpi cpu bind 搜一下就有。

或者结果slurm openpbs都可以实现。

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[硬件评测] 对于双路CPU服务器，如何将一个并行任务指定在特定CPU上运行