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[GROMACS] 构建PA膜时,怎么保证盒子里的单体只与MPD-TMC二聚体反应?

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老师们,我想学习重现一下这篇文章中构建聚酰胺膜的过程,文章中提到,将300个MPD、200个TMC、10个MPD-TMC二聚体放到盒子里,单体只能和10个二聚体反应生成酰胺键,而不能相互反应,请问怎么可以实现啊


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发表于 Post on 2020-7-14 15:41:55 | 只看该作者 Only view this author
没上下文没法说。看Fig. S1是什么结构。如果只是根据初始分子排布区域保证这一点,用packmol建模时恰当设置出现方式就完了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-7-15 09:35:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-14 15:41
没上下文没法说。看Fig. S1是什么结构。如果只是根据初始分子排布区域保证这一点,用packmol建模时恰当设置 ...

好的,谢谢老师

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