计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 6759|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Amber] 求助AMBER-GAUSSIAN 连用QM/MM计算L602问题

[复制链接 Copy URL]

99

帖子

0

威望

1303

eV
积分
1402

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 hhhnano 于 2020-7-12 12:56 编辑

在进行QM/MM结构最小化时,GAUSSIAN计算出现L602错误,在网上查了一下,主要是金属例子计算没有设置半径出现这种错误,可我的酶蛋白中没有金属离子,不知道为如何解决?非常感谢!
Leave Link  601 at Fri Jul 10 09:24:00 2020, MaxMem=  6710886400 cpu:         6.1
(Enter /home/xzhfood/gaussian/g09/l602.exe)
Did not find a floating point number as input
Error termination via Lnk1e in /home/xzhfood/gaussian/g09/l602.exe at Fri Jul 10 09:24:00 2020.
Job cpu time:       0 days  3 hours 39 minutes  3.3 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   1182 Int=      0 D2E=      0 Chk=     30 Scr=      1

AMBER 控制文件:

Initial min of our structure QMMM
&cntrl
  imin = 1, maxcyc = 5000, ncyc = 2000,
  ntx = 1,
  irest = 0,
  ntb = 0,
  cut = 20.0, ntc = 2, ntf = 2,
  ntpr= 1000,
  ntwx = 1,
  restraint_wt= 2.0,
  ifqnt = 1
&end
&qmmm
qmmask=':1,12,15,122,263,294,295,8573'
  qmcharge = 0,
  spin = 2,
  qm_theory = 'EXTERN',
  qmshake= 1,
  qm_ewald= 0, qm_pme= 1,
  qmmm_int = 1
  qmcut = 8.0,
  diag_routine = 0,
  writepdb= 1
&end
&gau
method = 'B3LYP',
basis = '6-31G*',
num_threads = 28,
mem = '50GB'
dipole = 1,
use_template = 1,
&end


gau_job.tpl 文件:

#P B3LYP/6-31G* SCF=(Maxcyc=500,Xqc,Conver=8) IOP(6/50=1)  

qmmm







本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 04:00 , Processed in 0.156264 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list