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[GROMACS] 请问Na+与溶剂分子中O的距离是通过第一溶剂化层尖峰所在的位置判断的吗?

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本帖最后由 Hanna110 于 2025-11-12 19:47 编辑

请问左边d图Na+(紫球)和溶剂分子中的O(红球)之间的距离是通过c图第一溶剂化层的尖峰所在的distance来判断的吗?文中没有具体描述,对比c、d图的坐标感觉像,但不确定。

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2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-12 19:46:50 | 只看该作者 Only view this author
是这样的,找到了其他文献中有说

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