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[建模与可视化] 求助:表面吸附计算时晶格尺寸如何确定

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楼主
各位老师好,我想做一个石墨烯结构对S8环吸附能的第一性原理计算。看到论坛中有帖子说晶胞的大小要依次增大来计算吸附能,直到吸附能变化很小,从而确定晶胞大小。
因为S8环分子较大,大约5埃米左右,我从6*6的石墨烯超晶胞(12.78埃米)开始计算,算到7*7的时候几何优化就很慢了...我是用CASTEP计算的,可能计算效率不如VASP高。
因而想向各位老师请教一下,除了逐个计算吸附能的方式,有没有其他办法能判断邻近分子(相邻盒子内的S8分子)间无相互作用的方法?!
我的理解是,计算对单个分子的吸附时,建立足够大的晶胞就是为了防止周期镜像分子间的相互作用。

刚开始转行接触第一性原理计算,如果问题提的太业余了,恳请各位老师见谅!烦请老师们指教!不甚感激!!!

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发表于 Post on 2020-7-31 01:13:36 | 只看该作者 Only view this author
上来就用个足够大的晶胞,虽然比挨个测试选出来的最小可用晶胞要更耗时,但省去了来回测试的时间,反倒更为划算
和相邻镜像距离>=12埃一般就认为色散作用已经收敛得很充分了。

没有埃米一说,只有埃

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发表于 Post on 2020-7-31 16:28:22 | 只看该作者 Only view this author
S8环分子似乎是镜像对称的,两个对称面也是垂直的,那么计算的时候只用1/4大小的晶胞,把1/4的S8环分子放在晶胞的角上,由于周期性边界的关系,1/4的S8环分子恢复成一个整分子,这样的话计算的时候只计算原来1/4大小的晶胞就可以了   
当然,上面的方法可以用来大致确定了吸附分子间的距离之后,还应该实际计算完整晶胞的分子吸附,确定是不是正确的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-2 14:41:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-7-31 01:13
上来就用个足够大的晶胞,虽然比挨个测试选出来的最小可用晶胞要更耗时,但省去了来回测试的时间,反倒更为 ...

好的好的,非常感谢sob老师的解答与纠正!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-2 14:46:42 | 只看该作者 Only view this author
flwboka 发表于 2020-7-31 16:28
S8环分子似乎是镜像对称的,两个对称面也是垂直的,那么计算的时候只用1/4大小的晶胞,把1/4的S8环分子放在 ...

好的好的,十分感谢老师的解答!我去认真研究一下!

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