如何搜索脱去磺酰基的过渡态

tianmafei · 发表于 Post on 2022-5-28 11:02:12

各位老师好！我在做脱去磺酰保护基的过渡态计算，推测可能为E1cb反应机理，先把4号位的质子脱去了，找到了脱去质子的过渡态，也跑了对应的IRC，接着尝试扫描硫氮键，想找到脱去磺酰基的过渡态初猜，但扫描出的能量是一直升高的。我用的计算水平是b3lyp/6-31+g**，em=gd3bj。请问老师们，这里面需要注意什么因素或问题吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-5-28 15:04:35

脱去磺酸基的时候磺酸基会偏离平面（只要画出前线轨道就能分析出这一点），如果初始结构的平面性特别好，扫描的时候结构一直维持平面性，就会导致能量过高

tianmafei · 发表于 Post on 2022-5-28 17:57:46

wzkchem5 发表于 2022-5-28 15:04
脱去磺酸基的时候磺酸基会偏离平面（只要画出前线轨道就能分析出这一点），如果初始结构的平面性特别好，扫 ...

多谢老师的答复！扫描到中间的时候氮杂环确实变成是平面的，我们也期望如此，希望脱去磺酰基后发生芳构化。那有没有什么办法能够找到脱磺酰基的过渡态？或者猜想一个结构初猜也行？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-5-28 18:13:23

tianmafei 发表于 2022-5-28 10:57
多谢老师的答复！扫描到中间的时候氮杂环确实变成是平面的，我们也期望如此，希望脱去磺酰基后发生芳构化 ...

氮杂环确实应该是平面的，我的意思是磺酰基在脱除的过程中需要偏离氮杂环平面，这样才有轨道重叠

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