计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10034|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 注意gaussian 16 C.01使用external时的问题

[复制链接 Copy URL]

1633

帖子

4

威望

4093

eV
积分
5806

Level 6 (一方通行)

喵星人

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-8-18 12:53 编辑

Gaussian 16 C.01版本,使用external调用其他程序(xtb)计算/优化时,某些结构会提示超价态需要d函数,导致社长之前的调用xtb脚本失效。(orca尚未测试,是否存在相同问题未知)
且同时写上含有d的基组无法解决。可能是由于B.01中更新的DFTB parameters are now read in Link 301 before the basis set is constructed, so that the presence or absence of d functions for an element can be taken from the parameter file.设置所导致。
不完全确定是这个原因,主要是发现在A.03正常运行的输入文件用C.01无法运行,out文件中警告为
Warning!  P  atom    2 may be hypervalent but has no d functions.(含有P配体)
文件末尾输出
Generating mol.tmp
Generating mol.xyz via genxyz
Running: xtb mol.xyz  --gfn 1 --chrg 0 --uhf 0 --hess --grad --g Toluene > xtbout
xtb running finished!
Extracting data from xtb outputs via extderi

目录下没有生成.mol或.xyz文件而使用完全相同的关键字,将分子结构改为普通有机分子则正常运行,使用COD配体的Rh配合物也可正常运行。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112440

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-8-18 15:58:58 | 只看该作者 Only view this author
C.01不怎么样,还引入了会出现fort.7文件的bug
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

417

帖子

1

威望

2198

eV
积分
2635

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2020-8-19 02:36:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-18 15:58
C.01不怎么样,还引入了会出现fort.7文件的bug

我之前还想不通呢!我用C.01时,经常出现fort.7文件,相应的输出文件末尾有“The archive entry for this job was punched.”,但我输入文件的关键词中没有“punch”。原来是个bug啊!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 07:31 , Processed in 0.158431 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list