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[GROMACS] 求助gromacs能量最小化中间有几步出错,后来又正常了,模型可以用吗

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能量最小化的时候,没采用柔性水时,中间有几步出错,后来又正常了,过程如图,这样的模型可以用吗。采用柔性水的话,无法收敛



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发表于 Post on 2020-8-31 17:43:36 | 只看该作者 Only view this author
对于动力学模拟目的,本来能量极小化过程就不需要收敛得多充分
别管em过程提示什么,只要之后MD能正常跑起来就行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-1 14:55:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 baima 于 2020-9-1 15:17 编辑
sobereva 发表于 2020-8-31 17:43
对于动力学模拟目的,本来能量极小化过程就不需要收敛得多充分
别管em过程提示什么,只要之后MD能正常跑起 ...

谢谢sob老师回复!

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