求助溶质在溶剂下的自由能的计算中能否在IEFPCM下几何优化最后用SMD计算溶解自由能

mt13 · 发表于 Post on 2020-9-3 17:12:46

请教老师，之前sob老师在初级班讲到，关于溶质在溶剂下的自由能的计算，第一步是在中等水平下优化，得到下面几步所用的结构；最后一步是用M05-2X/6-31G*结合SMD计算溶解自由能。
也讲到，“在优化和振动分析过程中使用SMD时，极个别情况下可能造成本来是高对称性的结构出现虚频、优化收敛变得困难，而默认的IEFPCM则没这个问题”。
我现在的体系是局部显离子性的，要用溶剂模型做几何优化与振动分析，那为了避免优化和振动分析中出现问题，能否直接用IEFPCM做优化与振动分析，最后用SMD计算溶解自由能？如果可以这样做，审稿人是否可能会质疑？

thanhtam · 发表于 Post on 2020-9-3 17:26:23

可以的

DoubeeTwT · 发表于 Post on 2020-9-3 18:15:35

还没做呢，怎么就知道会有收敛问题呢？SMD也不是只要遇到就不能收敛，先用SMD做，做不了有问题再考虑用差一点的选择

mt13 · 发表于 Post on 2020-9-3 18:26:59

thanhtam 发表于 2020-9-3 17:26
可以的

谢谢

mt13 · 发表于 Post on 2020-9-3 18:34:36

DoubeeTwT 发表于 2020-9-3 18:15
还没做呢，怎么就知道会有收敛问题呢？SMD也不是只要遇到就不能收敛，先用SMD做，做不了有问题再考虑用差一 ...

谢谢。在opt freq时，已经有个结构是scf不收敛了，试了novaracc未解决，正在试vshift。之前没加smd，opt是正常收敛的。所以在想直接IEFPCM下opt freq，免得折腾一遍。请问，如果smd不收敛，能否用geom=check和guess=read同时改成PCM继续算？

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-3 22:06:47

mt13 发表于 2020-9-3 18:34
谢谢。在opt freq时，已经有个结构是scf不收敛了，试了novaracc未解决，正在试vshift。之前没加smd，opt ...

可以

SMD相对于IEFPCM只是几何优化相对更容易收敛，而对SCF收敛性没什么必然的显著影响。

mt13 · 发表于 Post on 2020-9-3 22:25:21

sobereva 发表于 2020-9-3 22:06
可以

SMD相对于IEFPCM只是几何优化相对更容易收敛，而对SCF收敛性没什么必然的显著影响。

谢谢老师。还想请教一下，计算溶质在溶剂下的自由能，用IEFPCM做振动分析得到自由能的热力学校正量，是否需要计算非极性部分？

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-4 03:22:46

mt13 发表于 2020-9-3 22:25
谢谢老师。还想请教一下，计算溶质在溶剂下的自由能，用IEFPCM做振动分析得到自由能的热力学校正量，是否 ...

不用
算溶解自由能时候考虑非极性部分即可

mt13 · 发表于 Post on 2020-9-4 08:05:06

sobereva 发表于 2020-9-4 03:22
不用
算溶解自由能时候考虑非极性部分即可

谢谢老师

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