计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9447|回复 Reply: 13
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 审稿意见求助,关于溶液中熵校正问题

[复制链接 Copy URL]

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

最近审稿意见回来后,编辑给了一个意见,“From my side I would complete the reference 16 and 17 concerning the entropic correction in solution (which is a complicate matter). Examples of such discussion may be found e.g. L. Falivene, et al. Mol. Catal., 452 (2018) 138-144; M. Besora, et al. J. Phys. Chem. A, 122 (2018) 1392-1399.” 由于本文中用了方老师的THERMO 程序作了气相中的熵矫正,现在说的意见应该是让在溶液中做一下熵矫正,这种情况下应该怎么回答。

1万

帖子

0

威望

9893

eV
积分
22141

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-11-8 14:32:39 | 只看该作者 Only view this author
你的溶剂化效应是怎么考虑的?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2020-11-8 14:41:41 | 只看该作者 Only view this author
这审稿人啥意思,审稿人说的JPCA那篇里的结论是(根据他做的这一个测试)默认方法就挺好,其他的矫正越做越差;然后审稿人让加矫正?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125190

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2020-11-8 18:42:56 | 只看该作者 Only view this author
校正是完全多余的。在论坛里之前我就回复过


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-8 20:54:29 | 只看该作者 Only view this author
谢谢版主

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-8 20:56:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-8 14:32
你的溶剂化效应是怎么考虑的?

我文章中用的是方德彩老师小组用的THERMO program,考虑溶液中的平动熵矫正。

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-8 20:57:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-8 18:42
校正是完全多余的。在论坛里之前我就回复过

我之前用的方德彩老师小组的程序进行了一个溶液中的平动熵矫正,如果正如那篇JCPA文章中所说,这些矫正都是多余的,我应该咋回复阿

1万

帖子

0

威望

9893

eV
积分
22141

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2020-11-8 21:49:47 | 只看该作者 Only view this author
chunhui201 发表于 2020-11-8 20:56
我文章中用的是方德彩老师小组用的THERMO program,考虑溶液中的平动熵矫正。

我是说你的量化计算用的是什么溶剂模型,PCM?CPCM?COSMO?SMD?还是其他?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-8 22:18:20 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-8 21:49
我是说你的量化计算用的是什么溶剂模型,PCM?CPCM?COSMO?SMD?还是其他?

SMD模型

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-8 22:19:19 | 只看该作者 Only view this author
打错了,Thermo程序做的是溶液中的平动熵矫正

1万

帖子

0

威望

9893

eV
积分
22141

Level 6 (一方通行)

11#
发表于 Post on 2020-11-9 10:10:45 | 只看该作者 Only view this author

SMD模型本身就是拟合的溶剂中的总Gibbs自由能和气相的总Gibbs自由能之差,所以气相和溶剂里的平动熵的差别已经考虑在SMD模型的溶剂化Gibbs自由能里了,尽管并不是以物理意义明确的单独的一项的形式出现的,而是吸收到了经验参数里。所以再做校正确实多余。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 10:45:08 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-9 10:10
SMD模型本身就是拟合的溶剂中的总Gibbs自由能和气相的总Gibbs自由能之差,所以气相和溶剂里的平动熵的差 ...

是的,我也看了关于SMD模型的介绍。那怎么回复审稿人呢,这个总不能全部都去掉把数据在重新换一遍吧。

1万

帖子

0

威望

9893

eV
积分
22141

Level 6 (一方通行)

13#
发表于 Post on 2020-11-9 14:55:23 | 只看该作者 Only view this author
chunhui201 发表于 2020-11-9 10:45
是的,我也看了关于SMD模型的介绍。那怎么回复审稿人呢,这个总不能全部都去掉把数据在重新换一遍吧。

去掉也不难吧,毕竟你不需要做任何额外的量化计算,无非就是做几十次减法而已。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

18

帖子

0

威望

58

eV
积分
76

Level 2 能力者

14#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-9 21:29:53 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-9 14:55
去掉也不难吧,毕竟你不需要做任何额外的量化计算,无非就是做几十次减法而已。

谢谢wzkchem5的积极帮助。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 14:19 , Processed in 0.228176 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list