计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4517|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[使用经验] 如何在Linux分析硬件运行程序的瓶颈在哪儿?

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

637

eV
积分
646

Level 4 (黑子)

硬件千奇百怪,软件也各有不同。我们有了硬件,编译好软件后,如何系统分析硬件的短板在哪儿啦?
请教各位,能否提供分析方法?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-10-29 12:32:45 | 只看该作者 Only view this author
这个话题比较大。一般就是CPU、内存、硬盘速度、网络(跨节点的话)
诸如怀疑内存带宽影响大,可以用不同频率内存或者是否把所有内存通道利用满进行对比测试。对于硬盘,可以监控CPU占用率,如果硬盘读写速度成为瓶颈往往会观测到CPU占用率很低。等等
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

2302

帖子

1

威望

5481

eV
积分
7803

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2020-10-29 14:34:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 abin 于 2020-10-29 14:49 编辑

比如使用免费的, Ganglia。
图片示例

依据CPU负载、网络负载、内存占用,
基本能判定短板在什么地方。

应该还有别的性能分析方案。 比如nagios,或者付费的nagios XI。


要想不花钱呢,花时间研究如下的策略:
https://www.tecmint.com/command- ... -linux-performance/
https://www.cyberciti.biz/tips/top-linux-monitoring-tools.html
https://www.manageengine.com/pro ... nce-monitoring.html

不过nagios是最牛的一个方案。

如果Linux指令行玩的不怎么熟悉的话,也没功夫的话,
就不要浪费时间了。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2020-10-29 14:35:22 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2020-10-29 14:34
比如使用免费的, Ganglia。
图片示例就不上传。
因为提示:

图片保存成jpg就不会超标了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

9

帖子

0

威望

637

eV
积分
646

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-29 16:06:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-29 12:32
这个话题比较大。一般就是CPU、内存、硬盘速度、网络(跨节点的话)
诸如怀疑内存带宽影响大,可以用不同 ...

好的,谢谢

9

帖子

0

威望

637

eV
积分
646

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-29 16:07:10 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2020-10-29 14:34
比如使用免费的, Ganglia。
图片示例

,我试试,学习了

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 10:46 , Processed in 0.194100 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list