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[波函数分析求助] 求助:如何计算多环芳烃各个环的NICS?

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楼主
我只会计算单独一个苯环的NICS,但是像萘或菲这种多元芳烃的如何计算单独每一个环的NICS呢?

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发表于 Post on 2021-1-13 22:02:18 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Jing求索 于 2021-1-17 17:13 编辑

:) :) :)
1366731169 该用户已被删除
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发表于 Post on 2021-1-13 22:11:38 | 只看该作者 Only view this author
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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发表于 Post on 2021-1-13 22:12:18 | 只看该作者 Only view this author
算单个苯环不是取碳原子的中心嘛
你算多环芳烃的单个环,就取组成那个环的原子的中心就行了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-14 10:01:54 | 只看该作者 Only view this author
Jing求索 发表于 2021-1-13 22:02
邱美佳,
我是菜鸟,能添加我成为朋友吗?
我想向你提出问题,我挺着急的...

添加第一个五元环的时候先限制点群为D5h,然后用ctrl+shift+v重叠复制一个茂环,再用alt+中建把他拉出来。然后用alt+ctrl进行旋转,然后将点群限制为D5d。添加铁原子的话就选中所有原子,然后点击builder里面的place fragment at centroid那一项就可以。要检查每次添加点群是不是添加成功。可以用同样的方法在两个五元环的中心添加随便什么原子,然后调节中心的原子与铁原子的距离就可以。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-14 10:03:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-1-13 22:12
算单个苯环不是取碳原子的中心嘛
你算多环芳烃的单个环,就取组成那个环的原子的中心就行了

是不是在各个环中心都添加虚原子,就可以同时算各个环的NICS呀?

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发表于 Post on 2021-1-14 10:31:53 | 只看该作者 Only view this author
邱美佳 发表于 2021-1-14 10:03
是不是在各个环中心都添加虚原子,就可以同时算各个环的NICS呀?

可以
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-1-15 05:53:50 | 只看该作者 Only view this author
Jing求索 发表于 2021-1-13 22:02
邱美佳,
我是菜鸟,能添加我成为朋友吗?
我想向你提出问题,我挺着急的...

别在其它帖子里问和主题无关的问题,属于扰乱论坛秩序的行为,下次直接删帖+扣分处理
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