小分子过膜PMF曲线疑惑求解

熊小熊 · 发表于 Post on 2022-11-6 10:49:06

大家好，我想问问我计算了不同电场强度下的小分子过膜PMF，其中不只改变了电场强度，其他的都是一样的条件，但是两个PMF曲线所对应的X轴分布情况却不相同，在文献里面所看到的X轴对应的趋势变化是相同的，即应该是在同一距离下出现能垒，所以想请问一下，PMF曲线的X轴的值是对应的膜法线距离值，还是移动距离的值。

ZQQQD · 发表于 Post on 2024-9-12 17:38:32

您好，我想问一下您计算了不同电场强度下的小分子过膜PMF，是每个电场都重新进行一次拉伸吗？

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[GROMACS] 小分子过膜PMF曲线疑惑求解

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