计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 16115|回复 Reply: 28
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[算法与编程] libcint的使用求助

[复制链接 Copy URL]

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位走过路过的大佬好啊,本人新手,想尝试自己编写一些算法程序例如 (HF,MP2) 等,我不是专门做算法的,只是想深入的理解理论,所以计划直接采用现成的libcint电子积分库,奈何组里没有前辈,暂时也没找到好的资料,还请各位大佬指点一下如何使用该电子积分库,若有好的资料分享,感激不尽!

308

帖子

3

威望

6259

eV
积分
6627

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2019-7-16 20:53:30 | 只看该作者 Only view this author
没用过,都是自己写的。
欢迎使用量子化学软件Amesp

529

帖子

1

威望

5501

eV
积分
6050

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2019-7-16 21:59:03 | 只看该作者 Only view this author
安装包里自带了一个简单的说明,可以试着看看能不能看懂。积分库需要的是原子核坐标信息和相应的基函数信息,你要做的是根据这些信息准备atm,bas和env三个数组,传给相应的函数就可以了。我是用Fortran的,C的原理基本一样,我不知道你掌握到何种程度,不知道可以给你分享多少。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120201

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2019-7-17 02:13:22 | 只看该作者 Only view this author
有一定量化编程基础(比如能自己写出动能积分代码),看看libcint自带的例子文件和手册,有足够悟性就能调用libcint
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-17 10:06:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-17 02:13
有一定量化编程基础(比如能自己写出动能积分代码),看看libcint自带的例子文件和手册,有足够悟性就能调 ...

目前几乎没有量化编程基础,我是不是应该先看一下这方面的书籍呢?就看过彭的书,感谢

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-17 10:07:07 | 只看该作者 Only view this author
Warm_Cloud 发表于 2019-7-16 20:53
没用过,都是自己写的。

大师大法好

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-17 10:10:18 | 只看该作者 Only view this author
niobium 发表于 2019-7-16 21:59
安装包里自带了一个简单的说明,可以试着看看能不能看懂。积分库需要的是原子核坐标信息和相应的基函数信息 ...

你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了解的,不知道如何用程序来实现。

4114

帖子

4

威望

8875

eV
积分
13069

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

8#
发表于 Post on 2019-7-17 10:19:28 | 只看该作者 Only view this author
薛定谔的老猫 发表于 2019-7-17 10:10
你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了 ...

(1)Szabo的Mordern Quantum Chemistry, 第三章RHF讲的很详细;
(2)论坛里有几个人都上传过自己的HF,MP2编程笔记等资料,值得一看。
(3)仔细阅读libint2,libcint等积分库的说明。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-17 10:31:04 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2019-7-17 10:19
(1)Szabo的Mordern Quantum Chemistry, 第三章RHF讲的很详细;
(2)论坛里有几个人都上传过自己的HF ...

好的,我再琢磨琢磨,不会再来请教,可惜只能抽空弄啊!感谢

529

帖子

1

威望

5501

eV
积分
6050

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2019-7-17 10:37:47 | 只看该作者 Only view this author
薛定谔的老猫 发表于 2019-7-17 10:10
你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了 ...

建议先写MP2,熟悉量化公式如何转为程序。可以从现成的程序读取HF结果。
直接写SCF可能会打消你的积极性,毕竟现在成熟程序的SCF都比较强大,你很难超越,加速技巧也比较多,会比较费时间。
当然,MP2要能写出算200个基函数和2000个基函数的程序也是要花不同的时间的,但相对容易很多。

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-17 10:52:52 | 只看该作者 Only view this author
niobium 发表于 2019-7-17 10:37
建议先写MP2,熟悉量化公式如何转为程序。可以从现成的程序读取HF结果。
直接写SCF可能会打消你的积极性 ...

好的,感谢建议

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120201

管理员

公社社长

12#
发表于 Post on 2019-7-18 21:49:16 | 只看该作者 Only view this author
薛定谔的老猫 发表于 2019-7-17 10:10
你好,我也计划使用Fortran,但是目前量化编程基础几乎为0,尴尬。关键的问题就是,HF和DFT的理论还是了 ...

其实自己写不写出来程序和对理论理解的深度没有必然关系
诸如双电子积分,就是那么个数学公式而已,写出来只是增强编程水平和对积分在数学、数值算法上的理解,但并不提升对理论方法的理解。
所以如果最终目的也不是写个有实用性的量化程序,考虑到你现在对编程也不通,花那么多精力自己编程写完整的DFT计算程序真没必要,这些时间还不如再多看理论方面的书籍和文献来增进对理论的理解,这更有实际意义。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

529

帖子

1

威望

5501

eV
积分
6050

Level 6 (一方通行)

13#
发表于 Post on 2019-7-22 08:25:44 | 只看该作者 Only view this author
写了个简单的使用教程,希望对你有用

https://mp.weixin.qq.com/s?__biz ... 5&lang=zh_CN#rd

118

帖子

0

威望

1350

eV
积分
1468

Level 4 (黑子)

14#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-25 22:05:03 | 只看该作者 Only view this author
niobium 发表于 2019-7-22 08:25
写了个简单的使用教程,希望对你有用

https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU5NjMxNjkzMw==&mid=22474845 ...

哇,非常感谢

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120201

管理员

公社社长

15#
发表于 Post on 2019-7-25 23:16:28 | 只看该作者 Only view this author
PS:过几个月,两年前写了一半的《量子化学程序编写入门》会写完然后发布在网上。里面的程序就是基于libcint作为双电子积分计算模块的,到时候会结合例子讲得很详细
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 04:22 , Processed in 0.190907 second(s), 19 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list