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[Gaussian/gview] 关于在显式溶剂下优化分子的问题

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Iwonder if some of the intramolecular H-bonding would survive in an aqueousenvironment e.g. in the presence of explicit water molecules. The H-bondingwith explicit water molecules would lead to shifts in some of the vibrationalmodes that were not observed in the single molecule gas-phase structure andthis might hamper the proposed identification of the different conformers.审稿人提出了如上的评论,然后我建立了显式水分子溶剂模型,可是在DFT优化时。一直出现l202报错。
想请教各位大神如何应对审稿人的这个建议   拜托了

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喵星人

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发表于 Post on 2021-1-2 16:57:07 | 只看该作者 Only view this author
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-2 17:09:48 | 只看该作者 Only view this author
输出文件太大  我已上传图片
报错内容如下:
         Item               Value     Threshold  Converged?
Maximum Force            0.021390     0.000450     NO
RMS     Force            0.001826     0.000300     NO
Maximum Displacement          NaN     0.001800     YES
RMS     Displacement          NaN     0.001200     YES
Predicted change in Energy=          NaN
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

DSYEV returned Info=           2 IAlg= 2 N=     3 NDim=     3 NE2=           2.
Diagonalization in DiagDN failed.
Error termination via Lnk1e in /public/home/users/cauc001/g16/l202.exe at Sat Jan  2 02:13:42 2021.
Job cpu time:      46 days 20 hours  6 minutes 59.5 seconds.
Elapsed time:       1 days 11 hours 28 minutes 13.6 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    669 Int=      0 D2E=      0 Chk=     92 Scr=      1

0210102171011.png (86.53 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

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2hf.gjf

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发表于 Post on 2021-1-2 17:20:46 | 只看该作者 Only view this author
TMULYU 发表于 2021-1-2 17:09
输出文件太大  我已上传图片
报错内容如下:
         Item               Value     Threshold  Converg ...

输出文件压缩后再上传啊

B3LYP/3-21G还优化氢键复合物,完全是在搞笑
仔细看下文补充点最最最基本的常识
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210
乱谈DFT-D
http://sobereva.com/83
大体系弱相互作用计算的解决之道
http://sobereva.com/214
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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