求助怎么使用VMD将NAMD算出的运动轨迹中的蛋白分子导出？

llll210114 · 发表于 Post on 2021-1-15 10:39:22

本帖最后由 llll210114 于 2021-1-15 11:23 编辑

求助！怎么使用VMD将NAMD算出的运动轨迹中的蛋白分子导出？即如何去掉水分子和一些离子？

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2021-1-15 10:48:36

建议先好好看看新社员必读，然后改一下你的标题和问题描述

sobereva · 发表于 Post on 2021-1-15 11:50:01

选save coordinate，selected atoms里写上需要保留部分的选择语句，参看：
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504（http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html）

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[VMD] 求助怎么使用VMD将NAMD算出的运动轨迹中的蛋白分子导出？