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[综合交流] 求助-分析无自由能垒反应的方法

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楼主
老师们,最近做了一个液相小分子反应,反应机理是H原子转移过程,不加催化剂时,自由能垒为10kcal/mol左右,加了水或者酸性分子起到H桥的催化作用之后,经过柔性扫描发现没有能垒,因此想向大家请教一下,有没有什么方法能够从结构上或者其他的方式分析一下催化剂起到的作用,从而让反应更容易发生了呢。谢谢啦!

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发表于 Post on 2021-1-30 16:06:36 | 只看该作者 Only view this author
最简单的方式就是分析原子电荷,从原子电荷的层面如果发现这个反应的过渡态比反应物更富电子,那就自然说明加入酸性分子形成氢键是有用的
其他方法也有很多,看前线轨道、NBO等
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-30 17:00:10 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-1-30 16:06
最简单的方式就是分析原子电荷,从原子电荷的层面如果发现这个反应的过渡态比反应物更富电子,那就自然说明 ...

谢谢您的回答,就是我加入了酸性分子之后,就没有能垒了(加入酸性分子之后直接优化即可到产物,并且柔性扫描从反应物到产物能量一直下降),相应的就没有过渡态,那我应该用哪个结构跟反应物对比呢。能否辛苦给与更多的解释,刚开始做这个,还不是很清楚这些分析方式。感谢感谢

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发表于 Post on 2021-1-30 17:15:11 | 只看该作者 Only view this author
Somnus荣小荣 发表于 2021-1-30 17:00
谢谢您的回答,就是我加入了酸性分子之后,就没有能垒了(加入酸性分子之后直接优化即可到产物,并且柔性 ...

我的意思是就分析加酸性分子之前的反应物的电荷就够了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-1-30 19:23:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-1-30 17:15
我的意思是就分析加酸性分子之前的反应物的电荷就够了

好的 谢谢您,我试试。

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