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[GROMACS] 求助:Gromacs模拟完四聚体变单体

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各位老师好,想麻烦问一下各位老师我再跑gromacs前用的结构是四聚体,但是再把四聚体拆成蛋白和小分子并且合起来后形成的gro文件,用editconf转换成pdb文件的时候,pymol显示是单体,并且即便是模拟完后用editconf转换的pdb也是单体,所以想麻烦问一下各位老师,这个是editconf会直接转换成单体还是说我整个模拟过程中被当作单体处理呀?谢谢各位老师!

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发表于 Post on 2021-2-7 21:52:17 | 只看该作者 Only view this author
到底结构文件里有什么,直接打开pdb文件一看便知

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-9 08:10:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-2-7 21:52
到底结构文件里有什么,直接打开pdb文件一看便知

建议用VMD查看

好哒,谢谢社长~

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