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[Gaussian/gview] 溶剂化效应的计算请教

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楼主


我参考http://sobereva.com/327?replyto=159里面的计算例子,但是结构改用SMD模型下的优化结构,详细能量计算如下

1.     使用M06-2X/6-31G*优化结构与计算热校正能量,得到溶剂化下的电子能量(a)与自由能热校正量(b)
2.     使用(1)之结构,以M06-2X (D3) / 6-31G*方法计算真空下的单点能量,得到真空下的电子能量(c)
3.     使用(1)之结构,以PWPB95 (D3) / def2-QZVPP方法计算真空下的单点能量,得到真空下的高精确电子能量(d)
最后的总能为(d) + (b) + (c-a) +1.89/627.5095

不知道这样是否正确?


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发表于 Post on 2021-2-11 13:29:59 | 只看该作者 Only view this author
(c)不应该加D3,而且(c-a)应该是(a-c)。其他没什么问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-11 13:48:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 sun0615 于 2021-2-11 13:53 编辑
wzkchem5 发表于 2021-2-11 13:29
(c)不应该加D3,而且(c-a)应该是(a-c)。其他没什么问题

谢谢您的回复,是(a-c),上面笔误

至于计算溶解自由能时是否应该加D3是否有比较详细的解释,或是例子可以参考?

上面有写错的地方,本来「1.使用M06-2X/6-31G*优化结构与计算热校正能量」是要写M06-2X (D3)/6-31G*

因此如果(c)不应该加D3,那应该是结构优化加D3,之后另外计算不加D3的溶剂化单点能量-真空单点能量,或是结构优化就不加D3?


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发表于 Post on 2021-2-11 16:46:06 | 只看该作者 Only view this author
sun0615 发表于 2021-2-11 13:48
谢谢您的回复,是(a-c),上面笔误

至于计算溶解自由能时是否应该加D3是否有比较详细的解释,或是例子 ...

同一个结构下的D3色散校正和是否加溶剂无关,所以a和c的D3贡献刚好抵消,加了等于白加
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-2-11 23:24:41 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-2-11 16:46
同一个结构下的D3色散校正和是否加溶剂无关,所以a和c的D3贡献刚好抵消,加了等于白加

谢谢老师,所以a-c的结果与色散校正无关,那么为了让结构较准确,在结构优化时使用D3,则溶剂化下的电子能量(a)为加上D3后的能量,并在在计算真空能量(c)时同样加上D3让他抵销,这样做是否是正确的呢?

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发表于 Post on 2021-2-12 10:24:41 | 只看该作者 Only view this author
sun0615 发表于 2021-2-11 23:24
谢谢老师,所以a-c的结果与色散校正无关,那么为了让结构较准确,在结构优化时使用D3,则溶剂化下的电子 ...

可以

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eV +4 收起 理由
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sun0615 + 4 謝謝老師,新年快樂!

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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