求助模拟液态水分子动力学温度设置

elpa · 发表于 Post on 2023-1-6 10:24:39

最近发现很多做水的第一性原理分子动力学(AIMD)相关的文献都使用高于300K的温度(320K-350K)，理由是300K温度下GGA泛函模拟会产生液态水的glassy behavior，见该文献（https://doi.org/10.1063/1.1828433）。但是将温度升高后计算体系其他性质是不是也受影响？比如与分子的速度有关的量，PMF等方法计算自由能垒等。

bobosiji · 发表于 Post on 2023-1-6 17:42:45

肯定会。对于“PMF等方法计算自由能垒”，你试试用classical MD算不同温度的PMF，然后假设温度对classical MD以及AIMD算的PMF的影响都是一样的？

elpa · 发表于 Post on 2023-1-6 19:59:38

bobosiji 发表于 2023-1-6 17:42
肯定会。对于“PMF等方法计算自由能垒”，你试试用classical MD算不同温度的PMF，然后假设温度对classical ...

有道理

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