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[Lammps] 求助:在lammps中引入开关函数模拟偶氮苯类化合物N=N双键的翻转,如何实现?

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本帖最后由 wangyi 于 2021-3-19 11:04 编辑

本人是lammps小白,想用lammps计算偶氮苯类衍生物N=N双键的翻转,具体的计算思路参考文献:Journal of Chemical Physics, 2013, 139(1):224-5882,(1)弛豫一定时间;
(2)输出C-N=N-C二面角信息,产生与其数量对应的0-1间的随机数;
(3)计算开关函数P(φ)(C-N=N-C二面角),比较随机数和开关函数的大小,分别赋予顺式-反式的力场和反式-顺式的力场;
(4)重新计算,计算完返回第一步;
(5)执行这样n个循环。
文献中的流程如图所示,主要是获得特定的二面角信息、产生随机数与在执行循环和判断不太会处理,希望各位老师不吝赐教。

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