求助：gromacs做能量最小化后结构跑散了是什么原因

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-3-25 20:21:28

各位老师，我想模拟一个环糊精在水溶液中的体系，可是我做完能量最小化那一步后环糊精好几个结构都跑散了，请问这是什么原因呢？输入文件在附件中。麻烦各位老师帮我看看，谢谢！

SpongeBob · 发表于 Post on 2021-3-25 20:43:25

你是指的周期性？

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-3-25 23:36:07

SpongeBob 发表于 2021-3-25 20:43
你是指的周期性？

好像确实是周期性显示的问题

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[GROMACS] 求助：gromacs做能量最小化后结构跑散了是什么原因