求助: 安装gromacs后bin目录没有GMXRC文件

Agathaijia · 发表于 Post on 2021-6-23 19:06:00

本帖最后由 Agathaijia 于 2021-6-23 19:32 编辑

我在Gromacs网站上下载了安装包，并按照网站上“quick and dirty installation”的步骤进行安装，安装过程没有报错，make check的结果也全部是pass。
但最后一步source时，我的bin目录中并没有GMXRC文件，想请问老师们是为什么呢？是我的安装有问题吗？谢谢老师！
安装步骤如图

实际上，我根据教程，用自己的蛋白和小分子成功生成了拓扑文件，定义了盒子与溶剂，添加了抗衡离子。但是做能量最小化时，运行命令

gmx mdrun -v -deffnm em

复制代码

程序报错，错误为：Segmentation fault (core dumped)
我在论坛上查找解答，看到有老师回复可能由于软件版本过低导致的，所以我检查了自己的软件，发现虽然我下载的是比较新的版本（我尝试了安装2021.2和2020.6），但安装的版本似乎是2018.1。所以怀疑自己安装过程出现了问题，在此请教各位老师，谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2021-6-23 22:33:57

这是最简单也是最正确的安装方法
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http://bbs.keinsci.com/thread-11821-1-1.html）

Agathaijia · 发表于 Post on 2021-6-24 11:17:23

sobereva 发表于 2021-6-23 22:33
这是最简单也是最正确的安装方法
GROMACS的安装方法（含全程视频演示）
http://sobereva.com/457（http:/ ...

谢谢sob老师，不过我想确认一下我遇到的问题是否确实是由于版本或安装问题导致的呢？
因为我前面几步操作都没有遇到这个问题呢。

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