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[GROMACS] 粗粒化模拟萃取过程的力场选择问题求助

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楼主
大家好,我目前想用粗粒化分子动力学模拟两相萃取体系,就是两亲性的表面活性剂萃取金属离子,主要是看形成过程中的胶束和第三相,所以想请教一下大家,什么样的粗粒化力场比较合适?非常感谢!

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发表于 Post on 2021-3-24 11:02:07 | 只看该作者 Only view this author
没有特别的必要性不要用粗粒化力场
如今的计算条件用联合原子力场如GROMOS跑起来也一点不困难。粗粒化在描述相互作用精度、普适性上都有很大局限性,容易被质疑
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-26 08:37:19 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师回答,但是我想描述他们形成胶束或第三相的趋势,需要非常大的体系才能形成胶束或第三相,全原子力场要求的时间特别久,所以想用粗粒化模型,所以想请教一下大家用什么粗粒化力场。

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