构建配体力场过程中使用g16遇到的问题

黄舒伟 · 发表于 Post on 2021-4-1 22:02:25

请问一下，在参照使用AmberTools+ACPYPE+Gaussian创建小分子GAFF力场的拓扑文件去构建配体力场过程中，我在用g16计算gjf文件的时候，忘记在末端加入gesp那两行了，但是计算完成了，生成了out和log文件，想请问我是否能利用这两个生成文件去继续构建配体的力场呢?还是说我得重新计算？如果可以继续的话，请问该怎么继续呢？

sobereva · 发表于 Post on 2021-4-2 03:24:39

用Multiwfn算RESP电荷方便灵活得多，看
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441（http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html）
计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果）
http://sobereva.com/476（http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html）
如果结构已经优化完了但是chk没留着，拿Gaussian重新算个单点得到chk，formchk转成fch后给Multiwfn做输入文件

怎么产生拓扑文件看
几种生成有机分子GROMACS拓扑文件的工具
http://sobereva.com/266（http://bbs.keinsci.com/thread-428-1-1.html）

用acpype产生拓扑文件后，自行把Multiwfn给出的RESP电荷复制到[atoms]的原子电荷那一列即可

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