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[GROMACS] 求助:力场问题求教,金属氧化物与细胞膜的模拟

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楼主
各位老师好:                                          我刚接触这方面,对于力场还不是很明白,网上看了一些解释,但还是不了解,请问一下金属氧化物与细胞膜的模拟应该采用什么力场?Gromacs中自带的CHARMM22说是全原子力场,适用于蛋白质。CHARMM27,适合核酸和脂膜,这两种可以吗、还有其他选择吗?请问我该选择哪种?



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2#
发表于 Post on 2021-4-13 11:49:44 | 只看该作者 Only view this author
“CHARMM27,适合核酸和脂膜”这种说法有严重歧义
CHARMM27是CHARMM22的后继者,不是并列关系。越往后的CHARMM力场支持的体系类型越多,从最开始的蛋白质,到后来逐渐支持磷脂、DNA、糖。但无机物始终不是CHARMM力场支持的范畴,去搜文献看对于你研究的那类金属氧化物都用的什么参数。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-4-13 12:08:02 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢sob老师。

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