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[GROMACS] pdb2gmx处理蛋白C端时,CT2和3TER有什么区别吗?

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老师这两天考我,让我说出这些Terminus的区别,我不是很清楚,本来想每个都加下进行对比,发现3TER加不了,有哪位老师清楚他们的区别吗?感谢您的不吝赐教

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发表于 Post on 2021-5-12 13:47:51 | 只看该作者 Only view this author
核酸有5端和3端之分
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-12 14:23:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-12 13:47
核酸有5端和3端之分

卢老师,我是想问3TER这种端基和CT2在结构上和性质上有什么区别吗?百度谷歌都没看到

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发表于 Post on 2021-5-12 16:36:53 | 只看该作者 Only view this author
搞清楚核酸的结构自然就清楚
蛋白质残基怎么可能指认成5、3端,又不是核酸

搞清楚力场目录下后缀是.c.tdb、.n.tdb文件是干嘛的,看里面的信息理解

PS:说google就完了,百毒太low了,哪是搜和学术有关的东西能用的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-12 18:19:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-5-12 16:36
搞清楚核酸的结构自然就清楚
蛋白质残基怎么可能指认成5、3端,又不是核酸

谢谢卢老师,我看到您书里蛋白质的模拟有这部分的讲解,之前只看了rtp文件,我再去看看tdb文件

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