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[CP2K] 求助:CP2K使用PBE泛函进行几何优化出现极其怪异的崩溃结构

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近日使用我们学校超算中心编译的CP2K 7.1的PBE泛函对一个吸附有过硫酸根、水的矿物表面进行几何优化时(用钠离子做电荷平衡),发现优化所得的结果十分离谱,仿佛彻底散架一般,没有任何化学意义。更换赝势、基组,取消色散校正、偶极校正后均无效。我先前咨询过超算工程师,后者表示make test全部通过,不存在编译问题。现已束手无策,只得来此求助。

我也用超算的cp2k算了一下真空中过硫酸(中性的,不是过硫酸根)的结构:同样是PBE,Gaussian优化出了正常结构,CP2K的结果直接就裂开成了两个自由基,而且硫的位置还挺有问题……

现把输入文件、输出文件、优化过程放在附件的zip中。下图是高斯和CP2K过硫酸的优化结果对比

202105211320004597..png (56.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

CP2K 7.1

CP2K 7.1

202105211318526394..png (63.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

Gaussian 16

Gaussian 16

files.zip

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发表于 Post on 2021-5-21 15:38:24 | 只看该作者 Only view this author
   &POISSON
      PERIODIC NONE #Direction(s) of PBC for calculating electrostatics
      PSOLVER ANALYTIC #The way to solve Poisson equation
    &END POISSON
这里为啥选择NONE,表面的话 应该是XY

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发表于 Post on 2021-5-21 15:44:13 | 只看该作者 Only view this author
你的INP文件中的结构构建也有问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-21 17:07:17 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2021-5-21 15:44
你的INP文件中的结构构建也有问题

谢谢!我改一下poisson。请问结构具体哪里有问题呢?

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发表于 Post on 2021-5-22 09:17:42 | 只看该作者 Only view this author
xexlalalan 发表于 2021-5-21 17:07
谢谢!我改一下poisson。请问结构具体哪里有问题呢?

我看了一下INPUT的结构,你这个结构是两边吸附吗?部分水貌似在真空层里面

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-22 12:47:18 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2021-5-22 09:17
我看了一下INPUT的结构,你这个结构是两边吸附吗?部分水貌似在真空层里面

是只有一边吸附的,另一边是拿钠进行电荷平衡。一开始的时候想加溶剂模型,因为单独一个钠离子极性太大,怕溶剂模型不好收敛,所以就给他用了显式溶剂。结果还是不好收敛,就又把隐式模型去掉了……但是模型懒得改了,索性这么算了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-5-23 13:09:47 | 只看该作者 Only view this author
jiangning198511 发表于 2021-5-21 15:38
&POISSON
      PERIODIC NONE #Direction(s) of PBC for calculating electrostatics
      PSOLVER  ...

非常感谢!确实是POISSION没有设置。设置成XYZ之后就完全正常了!

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