求助：用四点水模型跑水盒子结果不合理

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-6-5 01:09:39

请问我用OPC跑了一个纯水盒子，可是跑完查看水的结果发现怪怪的，每个水分子都有一些原子重叠在一起，这是为什么呢？

snljty · 发表于 Post on 2021-6-5 07:22:44

建议先了解一下什么叫四点水模型......

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-6-5 09:07:44

snljty 发表于 2021-6-5 07:22
建议先了解一下什么叫四点水模型......

多加的那个虚拟位点也是会显示出来的吗？

snljty · 发表于 Post on 2021-6-5 10:05:55

邱美佳发表于 2021-6-5 09:07
多加的那个虚拟位点也是会显示出来的吗？

不想显示就把选择语句里面写上not name MW，你上面截图很清楚了

邱美佳 · 发表于 Post on 2021-6-5 11:31:36

snljty 发表于 2021-6-5 10:05
不想显示就把选择语句里面写上not name MW，你上面截图很清楚了

好的，非常感谢！

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[GROMACS] 求助：用四点水模型跑水盒子结果不合理