l1111计算时CPU使用率低

shenzp · 发表于 Post on 2022-11-1 20:17:36

如题，我在自己的笔记本上用Gaussian16在CCSD/def2-TZVP级别下做两个原子的结构优化和振动分析，四个物理核心都给了程序，其它link计算时的CPU使用率基本都在50%以上，速度也都挺快，只有l1111的CPU使用率极低，基本上不超过5%，速度也非常慢，想求助一下是什么原因？感谢！

zjxitcc · 发表于 Post on 2022-11-1 20:57:48

歪个楼，2个原子的话，算十几个CCSD单点，拟合一下势能面就知道平衡键长（非常精确）的值了，不用opt+freq。

wjc404 · 发表于 Post on 2022-11-1 21:55:11

本帖最后由 wjc404 于 2022-11-1 21:56 编辑

l1111这个程序用来做高级别后HF方法的density和integral derivatives。它非常耗内存和磁盘，且并行效率低。算两个原子时用键长扫描或者数值梯度代替解析梯度，就不会调用它，速度可能还更快。

shenzp · 发表于 Post on 2022-11-1 21:56:22

zjxitcc 发表于 2022-11-1 20:57
歪个楼，2个原子的话，算十几个CCSD单点，拟合一下势能面就知道平衡键长（非常精确）的值了，不用opt+freq ...

确实，我之前没想到，谢谢！不过我还是想知道这是我的电脑的问题还是其它什么原因？

shenzp · 发表于 Post on 2022-11-1 22:16:55

wjc404 发表于 2022-11-1 21:55
l1111这个程序用来做高级别后HF方法的density和integral derivatives。它非常耗内存和磁盘，且并行效率低。 ...

所以说这是程序本身的问题？那像CCSD这种本身有解析梯度的怎么用数值梯度？还是说直接换CCSD(T)？

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-2 08:56:40

当进程大量读写硬盘，且硬盘速度成为瓶颈的情况，CPU就会闲着没事干，占用率必然低。你可以检查一下临时文件的尺寸看看
你的情况完全可以用CCSD(T)优化，到时候程序自动就会用数值梯度。

shenzp · 发表于 Post on 2022-11-2 10:49:31

sobereva 发表于 2022-11-2 08:56
当进程大量读写硬盘，且硬盘速度成为瓶颈的情况，CPU就会闲着没事干，占用率必然低。你可以检查一下临时文 ...

sob老师好！临时文件大小是几个G，我设置的默认硬盘大小是150GB，电脑硬盘是三星MZVLB512HAJQ-00000，512G，google到的读取速度是3000MB/s，写入速度是1800MB/s，感觉还行？以及我的电脑是轻薄本，不知道是不是因为散热不够性能会受限？我是电脑小白，还不太懂这方面的知识，希望老师见谅！
现在在尝试CCSD势能面扫描，发现到l804的时候CPU使用率也很低，l913也不高，只有l502能把CPU拉上去，但此时降频就很明显。

sobereva · 发表于 Post on 2022-11-3 08:44:37

shenzp 发表于 2022-11-2 10:49
sob老师好！临时文件大小是几个G，我设置的默认硬盘大小是150GB，电脑硬盘是三星MZVLB512HAJQ-00000，512 ...

跟散热没明显关系，虽然你也可以用AIDA64之类监控一下运行过程的温度
用CCSD远不如CCSD(T)，耗时也就差一两倍
也可以尝试装个虚拟机跑linux版Gaussian看看情况

shenzp · 发表于 Post on 2022-11-4 00:30:21

sobereva 发表于 2022-11-3 08:44
跟散热没明显关系，虽然你也可以用AIDA64之类监控一下运行过程的温度
用CCSD远不如CCSD(T)，耗时也就差 ...

今天装了虚拟机，后HF的还没试，试了一下M06-2X/def2-TZVP对CH4做构型优化和振动分析，发现计算时间不到windows版的一半，并行效率也接近4了，真是没想到自己四核轻薄本用linux效率也能高很多！谢谢sob老师！

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