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[GROMACS] 偶极方向与界面夹角问题

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楼主
各位前辈好,小弟最近在计算蛋白质在界面的吸附问题,想研究一下蛋白质的偶极方向与界面法向量之间的夹角随时间的变化情况,并把偶极方向用箭头标出来。
请问时有没有好的处理方式?

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2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-6-19 11:22:33 | 只看该作者 Only view this author
打扰各位,已经解决了。
gmx dipoles计算出dipole的各个分量,计算出与法向量的cos值
在vmd里手动绘制箭头。

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