计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10037|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助使用高斯进行优化时频繁报错的解决方法

[复制链接 Copy URL]

20

帖子

0

威望

123

eV
积分
143

Level 2 能力者

本帖最后由 yyllxx 于 2021-7-13 11:26 编辑

请教各位老师,在使用M06-2X方法对七分子团簇进行结构优化的过程中频繁报错,已经进行了两次计算,多次报错,以l103错误为主,第一次优化到200多步感觉无果停止结算(如图1,优化结果文件如1),第二次优化到500多步震荡感觉无果停止结算(如图2,优化结果文件如2)。图3是第三次计算过程中的第一次报错,老师这个错误还是按l103的方法处理吗?对这个分子团簇使用B3LYP-D3方法优化与频率计算过程非常顺利,为什么M06方法频繁报错甚至无果呢?
抱歉,文件1和文件2因为太大,上传不了,不知道我是否表达清楚我的问题与困惑,如果表达不清楚,我随时回复各位老师的疑问,谢谢你们!另外,我大概说一些我课题内容,我是研究太赫兹光谱的,最终研究的是弱相互作用,我用的方法是静电势分析+范德华势分析,贴几张已发表论文的图(图4,5,6,7)。图7是回答审稿人提问的为什么不使用其他计算方法给的结果,M06确实效果不太好,但是他可以解释B3LYP-D3解释不了的吸收峰,所以我还是想用M06方法计算现在的物质


1.png (11.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

图1

图1

2.png (20.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

图2

图2

3.png (17.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

图3

图3

QQ图片20210713112109.jpg (61.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

图4静电势分析图

图4静电势分析图

QQ图片20210713112132.png (37.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 21)

图5范德华势分析图

图5范德华势分析图

QQ图片20210713112253.png (26.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

图6太赫兹光谱图

图6太赫兹光谱图

QQ图片20210713112313.png (21.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

图7M06方法计算结果

图7M06方法计算结果

20

帖子

0

威望

123

eV
积分
143

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-13 10:54:09 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yyllxx 于 2021-7-13 11:31 编辑

因为现在很多文章还是解释不了太赫兹吸收峰与弱相互作用的关系,所以我想通过不同的计算方法(计算方法的侧重点不一样)来初步确认吸收峰与弱相互作用的关系,比如图6中B3LYP计算的1.16THz处的吸收峰没有出现在加色散校正的B3LYP的光谱中,所以我初步判定,1.19处的实验吸收峰,静电作用占主导。类似这样的想法,最后通过其他方法确认这个吸收峰确实是静电作用引起的,我执着与M06也是这样的原因,M06可以很好地描述范德华作用,那么是否可以解释一些范德华作用引起的吸收峰呢

37

帖子

1

威望

2068

eV
积分
2125

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2021-7-13 11:09:12 | 只看该作者 Only view this author
看sob老师的量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法:http://sobereva.com/164
也不知道你的输入关键词是什么样的,用g09 m06-2x泛函首先考虑加上int=ultrafine
还是震荡不收敛的话再考虑使用opt=calcfc或者calcall吧

20

帖子

0

威望

123

eV
积分
143

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-13 11:35:58 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yyllxx 于 2021-7-13 11:38 编辑

我现在课题出现的问题是 不管哪个方法计算出的光谱都与实验光谱有差大的差别,也没有很大的优势体现出实验光谱中的某个吸收峰确实有某种作用引起。请教各位老师,有什么方法提高光谱吻合度吗,并且能初步确认吸收峰的来源。图中是现在的课题计算的结果

5.png (15.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

5.png

1万

帖子

0

威望

9859

eV
积分
22096

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2021-7-13 15:05:25 | 只看该作者 Only view this author
yyllxx 发表于 2021-7-13 04:35
我现在课题出现的问题是 不管哪个方法计算出的光谱都与实验光谱有差大的差别,也没有很大的优势体现出实验 ...

搞不好是因为非谐性效应,谐振近似做不准
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125141

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2021-7-13 16:43:22 | 只看该作者 Only view this author
分清楚M06和M06-2X。不要用前者

用M06-2X不是好选择,计算慢,而且对积分格点敏感,对这种柔性体系几何优化收敛费劲还容易出虚频。

说清楚用的什么基组

尝试把团簇再取大一圈。或者用CP2K算周期性体系的振动分析
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

20

帖子

0

威望

123

eV
积分
143

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-13 20:41:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-13 15:05
搞不好是因为非谐性效应,谐振近似做不准

谢谢您的思路,我应该考虑频率校正因子的。

20

帖子

0

威望

123

eV
积分
143

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-13 20:42:41 | 只看该作者 Only view this author
qlyfe 发表于 2021-7-13 11:09
看sob老师的量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法:http://sobereva.com/164
也不知道你的输入关键词 ...

好嘞,谢谢你呀,我加关键词再试试

1万

帖子

0

威望

9859

eV
积分
22096

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2021-7-13 21:48:49 | 只看该作者 Only view this author
yyllxx 发表于 2021-7-13 13:41
谢谢您的思路,我应该考虑频率校正因子的。

这个应该不是单纯一个频率校正因子能解决的,频率校正因子只会整体缩放光谱的x轴,不会改变光谱的形状。可能需要考虑AIMD之类的方法
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

20

帖子

0

威望

123

eV
积分
143

Level 2 能力者

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-7-15 11:40:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-13 21:48
这个应该不是单纯一个频率校正因子能解决的,频率校正因子只会整体缩放光谱的x轴,不会改变光谱的形状。 ...

非常感谢您的耐心解释,我多了解一下其他方法,比如AIMD等

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-21 01:46 , Processed in 0.174356 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list