大体系算普通泛函的单点也需要硬盘速度？

djjj148

一次偶然的机会测试了一下大体系的普通泛函的单点，发现固态硬盘(PM981)和机械盘(希捷ST4000NM000A银河企业级)的计算速度差了20%。这与sob老师之前的测试结果(硬盘速度与内存容量对量子化学计算速度影响的测试)不太一样，故和大家分享一下。详细测试如下：191原子的有机体系，单机跑，机器56核Platinum 8173M，192G内存，计算时都分配170G。其他设置都一样，仅仅通过GAUSS_SCRDIR把临时文件的目录设置为固态或机械的对应目录。计算过程中产生的临时文件有14G。

1. # scrf=smd em=gd3bj pbe1pbe tzvp
   
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用时：
PM981：346m7.869s
希捷ST4000NM000A银河企业级：422m54.513s


或许对于大体系/临时文件较大的任务，即使是普通泛函也对硬盘速度敏感。

sobereva

我不太认为这是硬盘速度导致的差异

也可以对比直接用%rwf把rwf分别指定在两个硬盘上的耗时，也对比一下各个link在两种情况下执行的耗时。也建议多对比几个体系

djjj148

sobereva 发表于 2021-8-29 08:51
我不太认为这是硬盘速度导致的差异

也可以对比直接用%rwf把rwf分别指定在两个硬盘上的耗时，也对比一下 ...

谢谢建议。我等机器空闲了测试一下。