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[GROMACS] GROMOCS关于gmx energy的疑问

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Level 5 (御坂)

想算算水盒子的自由能变(δG和δA)和熵变(δS),遇到一些问题,想问问各位老师。

上图可以看到,NPT系综从4-4-3到4-4-7共5个,NVT系综从4-4-3+8到4-4-7+8也有5个,每个NVT系综Z方向都有两个厚4nm的真空区。
total-energy,potential,kinetic En等数据来自gmx energy;
倒数第二列的δG和δA数据来自gmx energy -fee -fetemp 298.15;
根据手册gmx energy一节的内容,可以知道有如下关系式(在2019.6手册中第85页):

可以得知可以分别对应NPT和NVT系综得到δG和δA,然后进而得到δS

上表便是NVT系综求得的 相应体系 对于 其理想气体状态下 的δS
至于PV项,在对NPT系综计算PV时,感觉得到的结果不对劲:

可以看到上图为4-4-3体系的PV项,所得结果和Pressure*Volume相去甚远。

因此我想问问NPT系综的PV该如何得到?对于NPT,如果gmx energy给出的pV明显不对劲,能不能直接用Pressure*Volume?
以及为什么会出现这种情况呢?还是我对pV项的理解有问题?亦或是实际程序给出的不是我理解的那个PV?

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