计算吸附气体模型的频率来计算零点能时固定原子的问题

lsq0829 · 发表于 Post on 2019-3-5 20:42:23

vasp计算吸附气体模型的频率来计算零点能，固定低层的原子，只计算吸附分子的频率还是所有原子都不固定计算所有原子的频率呢？后者计算量太大了-_-||

啦啦黑还黑 · 发表于 Post on 2019-3-7 16:17:13

把所有slab原子都固定。

飞翔的猪 · 发表于 Post on 2019-6-25 09:16:51

如果是二维材料比如掺杂石墨烯吸附氢原子，计算H*的频率，衬底是否需要固定呢？

张丽 · 发表于 Post on 2021-4-4 01:16:18

啦啦黑还黑发表于 2019-3-7 16:17
把所有slab原子都固定。

您好，请问如果是slab上还负载了金属单团簇，那这个团簇也要和slab一起固定住吗？

陪锂到天边 · 发表于 Post on 2021-10-8 01:36:21

啦啦黑还黑发表于 2019-3-7 16:17
把所有slab原子都固定。

为什么要固定所有的原子？吸附分子周围的原子为啥不用考虑呀？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-10-8 15:21:35

陪锂到天边发表于 2021-10-7 18:36
为什么要固定所有的原子？吸附分子周围的原子为啥不用考虑呀？

这是近似的处理方法，严格的处理方法是只把优化时固定的那些原子固定住（比如slab最下面两层）。固定所有slab原子可以降低很多计算量，但是会引入近似。不过个人觉得只有物理吸附可以固定所有slab原子，如果是化学吸附，起码应该把和吸附分子直接成键的slab原子放开，但这个我不确定，因为如果我做的话都是只把优化时固定的那些原子固定住

ghifi37 · 发表于 Post on 2021-10-8 20:15:17

wzkchem5 发表于 2021-10-8 15:21
这是近似的处理方法，严格的处理方法是只把优化时固定的那些原子固定住（比如slab最下面两层）。固定所有 ...

吸附物可以用hindered模型处理热力学数据，那与之相连的slab原子（或者说整个表层），用phonon处理好像也不合适。请教下如何处理相应热力学数据？

陪锂到天边 · 发表于 Post on 2021-10-11 22:05:12

wzkchem5 发表于 2021-10-8 15:21
这是近似的处理方法，严格的处理方法是只把优化时固定的那些原子固定住（比如slab最下面两层）。固定所有 ...

谢谢

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