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[波函数分析求助] 求助价层电子密度和ELF图分析

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本帖最后由 zhf0102 于 2021-11-5 10:50 编辑

各位老师好:
  我对La-Nd进行了价层电子密度和ELF分析,我有两个问题:
1. 价层电子密度图的颜色深浅代表什么作用呢? 2. 想请教各位老师,从我画的图中,可以看出从La-Nd,有什么样的变化呢?具体是从哪些颜色区域看出来的呢?

La-Nd_valence-density_ELF.png (732.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

La-Nd_valence-density_ELF

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发表于 Post on 2021-11-5 16:47:52 | 只看该作者 Only view this author
1 颜色的意义在色彩刻度条上已经直接体现了,数值就是价层电子的密度,含义很清楚,没什么可进一步解释的。

2 说清楚各个位置都是什么原子,把原子符号标出来。
从这些图上看不出显著差异,或者说差异性很小,难以从图形上讨论出什么,我也不知道你做这个分析的意图是什么。用Multiwfn做各种化学键相关的定量分析更容易体现差异性。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-6 10:47:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-5 16:47
1 颜色的意义在色彩刻度条上已经直接体现了,数值就是价层电子的密度,含义很清楚,没什么可进一步解释的。 ...

老师您好,从ELF图上,能看出从La-Nd的原子周围有颜色变化,我想知道,这样的变化能说明什么呢?

La-Nd_valence-density_ELF-02.png (394.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

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发表于 Post on 2021-11-6 17:37:07 | 只看该作者 Only view this author
zhf0102 发表于 2021-11-6 10:47
老师您好,从ELF图上,能看出从La-Nd的原子周围有颜色变化,我想知道,这样的变化能说明什么呢?

和镧系金属在当前体系时的电子组态有关,一方面是原子在孤立状态时的电子组态就有差别,另一方面也受到配体的影响。
二维图看不全面,等值面图才能展现得更充分。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-10 14:40:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zhf0102 于 2021-11-10 14:56 编辑
sobereva 发表于 2021-11-6 17:37
和镧系金属在当前体系时的电子组态有关,一方面是原子在孤立状态时的电子组态就有差别,另一方面也受到配 ...

Sob老师您好,     由于镧系元素的4f5d电子的不同,我想知道它们的不同导致了哪些变化,所以进行了一些分析

     1. 我对La-Gd的体系进行了Laplacian electron density分析,结果如图1所示,现在可以看出从La-Nd或从La-Gd有哪些变化呢?
     2. 图2是电子自旋密度,想问问能体现出什么变化吗?

     3. 我也按照您的博文做了基于Multiwfn使用NAO计算原子轨道贡献,如图3,好像找不到规律性的变化。
     4. 如果这些图还是体现不出什么变化的话,但我还是想从图形上看从La-Nd的变化,还有哪些或许可行的办法呢?

La-Pm-原子轨道贡献.png (94.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

图3

图3

La-Gd-bp86-electron spin density.png (544.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

图2

图2

La-Gd-bp86-Laplacian of electron density-1.jpg (245.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 12)

图1

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发表于 Post on 2021-11-11 04:22:53 | 只看该作者 Only view this author
zhf0102 发表于 2021-11-10 14:40
Sob老师您好,     由于镧系元素的4f5d电子的不同,我想知道它们的不同导致了哪些变化,所以进行了一些分 ...

图形化分析这个在我来看意义不大

另外,光拿把HOMO拿出来也没什么意义。对于UKS计算,自旋密度是由所有轨道共同贡献的。如果非要对自旋密度分布图给个解释,应当做个双正交化,得到近乎单占据的轨道
用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用
http://sobereva.com/448http://bbs.keinsci.com/thread-11377-1-1.html

然后对那些近乎单占据的轨道再做轨道成分分析,看Ln的各种原子轨道贡献是多少。而且不光看壳层贡献,还要看具体基函数的贡献,因为不同f原子轨道的形状不同。
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