计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8075|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VMD] Hydrogen Bond分析选区问题

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

33

eV
积分
42

Level 2 能力者

老师好,我再VMD中载入的是 .gro 和 .xtc (构型和坐标文件),体系是蛋白复合物,想利用Hydrogen Bond插件分析蛋白间的氢键,选区时出现问题,无法把AB蛋白分开。
请各位老师指导。
试了chain A/chain B ;A/B; 1-5261/5262-9537(原子序号)  以上三种搭配,均无法区分

VMD.png (69.05 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

VMD.png

9

帖子

0

威望

33

eV
积分
42

Level 2 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-9 15:17:39 | 只看该作者 Only view this author
选区问题已经解决

39

帖子

0

威望

701

eV
积分
740

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2021-11-15 16:38:17 | 只看该作者 Only view this author

请问一下,您上面提到的三种:chain A/chain B ;A/B; 1-5261/5262-9537(原子序号)方式,哪一种是对的呢?或者是其他什么搭配吗?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 18:27 , Processed in 0.164531 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list