求助：不清楚gmx hbond -life -ac 输出的xvg每列的表达含义

lyl20 · 发表于 Post on 2021-12-16 10:46:12

求助：不清楚gmx hbond -life -ac 输出的xvg每列的具体表达含义

sobereva · 发表于 Post on 2021-12-16 15:20:50

手册里有氢键分析命令的原理说明，把手册自己手册里提到的文献看了，自然就明白了。自相关函数在手册里也有介绍。
并且，在grace里对xvg把图作出来，纵坐标对应什么式子直接就能在图里看到

lyl20 · 发表于 Post on 2021-12-24 16:27:50

谢谢sob老师，
老师，如果我想求氢键寿命，用gmx hbond -life 则会输出Note that the lifetime obtained in this manner is close to useless
Use the -ac option instead and check the Forward lifetime，那么是不是就应该用gmx hbond -ac 输出的hbac.xvg第一、二列数据，进行指数拟合后进行积分得到？

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] 求助：不清楚gmx hbond -life -ac 输出的xvg每列的表达含义