QE结合LOBSTER进行晶体轨道重叠布居(COOP) 和晶体轨道哈密顿布居(COHP)分析求助

风飞 · 发表于 Post on 2021-2-20 22:04:29

本帖最后由风飞于 2021-2-26 19:12 编辑

老师，您好，我想使用LOBSTER进行COHP分析，但是遇到如下问题，请指教 1：我的QE，scf部分文件如图， lobsterin 如图，，lobster手册和常见问题如下

Lobster_Users_Guide_4.0.0.pdf (1.17 MB, 下载次数 Times of downloads: 125)

Lobster_FAQ_4.0.0.pdf (261.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 54)

2：正常计算完成后，我的结果输出中没有出现没有出现COHP.lobster文件，通过手册得知是因为选取的能带不够，于是我在QE输入文件中增加关键词"nbnd=500"（输入文件红色部分所示）,但是还是出现提示“the Hamilton matrix in the local basis, you need to use at least  486 bands. pCOHP analyses will be disabled. Please check the manual! ”，请问该怎样解决呢？

3. 在lobster手册中说写入：saveProjectionToFile  和 loadProjectionFromFile：两个关键词可以保存原子轨道基组信息到文件，这样从文件读取原子轨道基组信息可以加快计算，我计算后得到了projectionData.lobster 文件，请问在计算相同体系中另外两个原子的COHP时，怎样使用这个文件来加快计算呢？

4.lobster中有3种基组选择，分别是a) bunge (for elements up to Xe); b) koga;  c) pbeVaspFit2015 (up to Lr; yes, that is Z = 103).  对于VASP选择c) pbeVaspFit2015 (up to Lr; yes, that is Z = 103). 请问对于QE呢？lobster 默认的是bunge

5. 看到有关VASP结合lobster分析波函数的时候，需要去掉对称性，然后做非线性条件下的相对论自旋轨道耦合，得到全布里渊区的k点坐标，请问在QE计算中，该怎样操作呢？

6.手册中说lobster可以获得电荷的布局分析，并且存储在CHARGE.lobster中，请问这个是怎么产生和计算呢？
7.请问怎样处理lobster得到的数据呢？手册中说使用wxdragon ，但是我看到网页的的提示，（如下图a），感觉太麻烦了，就想提取数据用origin作图，但是不明白其每一栏对应的输出含义，例如其coop.lobster ,如下图b，红色所示一行有53列数据，但是不知道怎样去对应，我看了手册的描述，如下图c，也实在没有对上,

zxnzxn · 发表于 Post on 2021-5-12 15:35:25

请问同学这个问题解决了吗？the Hamilton matrix in the local basis, you need to use at least 486 bands. pCOHP analyses will be disabled. Please check the manual! 我也遇到了同样的问题

ghifi37 · 发表于 Post on 2021-5-12 16:49:30

增加空带数量

安大小黄 · 发表于 Post on 2021-5-19 10:26:47

请问同学你的问题解决了吗？

风飞 · 发表于 Post on 2021-5-19 10:55:33

安大小黄发表于 2021-5-19 10:26
请问同学你的问题解决了吗？

我没有得到COHP的结果，我只得到了COOP的结果，但是还不知道怎么去处理他合适

风飞 · 发表于 Post on 2021-5-19 10:56:16

ghifi37 发表于 2021-5-12 16:49
增加空带数量

嗯，好的，那我再去增加看看

DesignChemistry · 发表于 Post on 2022-2-23 18:50:28

本帖最后由 DesignChemistry 于 2022-2-23 19:02 编辑

2. 在输入文件里增加完以后应该再重新算一遍，lobster是在输出里边读取信息的

7. 有orbitalwise关键词，所以是具体某个轨道跟某个轨道的pCOHP，输出文件的开头应该就是具体对应的情况吧；25对相互作用的轨道都算了pCOHP和IpCOHP，再加上pCOHP averaged over all atom pairs specified和IpCOHP……以及第一列的Energy，正好是25*2+3=53列

其他我暂时也还不太懂

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