excimer和exciplex：如何利用团簇构象搜索找到最稳定构象？

seantan521 · 发表于 Post on 2021-11-22 16:16:02

本帖最后由 seantan521 于 2021-11-22 16:54 编辑

先给出两个使用场景：
例子1，在磷光客体材料中，我们需要避免掺杂的客体形成excimer（激基缔合物）发光。那么应该如何从计算上分析某金属配合物形成excimer的能力？
例子2，在磷光主体材料中，我们通常采用P-Host和N-Host形成的exciplex（激基复合物）来作主体。那么应该如何分析某两种不同结构的材料（先假设摩尔比1:1）形成的exciplex的性质？

经过浏览论坛的一些帖子后，我觉得问题的关键应该是找到excimer和exciplex的最稳定构象。找到之后，就可以将这种稳定构象当成一个分子导入Gaussian进行各种量化分析。
根据Sob老师的帖子（http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html）好像是借助molclus程序进行团簇构型/构象搜索，找到最稳定的构象。其大致步骤为：

a. 先基于第三方分子动力学程序或molclus自带的gentor/genmer组件等产生一批初始结构；
b. molclus调用量子化学程序或分子力学程序对这些结构依次进行优化；
c. molclus自带的isostat组件对结果进行归簇、排序，从而最终得到能量最低结构和能量较低的一批结构；
然后我挑选能量最低的一个或几个构象，导入Gaussian，将其当成一个分子进行计算分析即可，是这样吧？

这里我有几个疑问：
首先，之前分析和搜索的应该是基态最稳定构象吧，但是excimer和exciplex应该寻求的是激发态最稳定构象吧？这个应该如何处理？
其次，在最初导入具体结构时，是否有必要导入各个分子的基态优化构型，还是直接利用程序自带的组件自动生成即可？
最后，Sob老师提到“一定要注意不同分子团簇特点不同，构型搜索需要的参数、具体策略往往差异很大，没有唯一通用的处理办法”，那么对于不同的结构，需要调整哪些参数，不知道能不能给点指导意见。

在此，先谢谢各位老师们了！

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-23 10:04:13

用molclus做激基复合物和做基态复合物搜索的差别，仅在于对于前者需要在模板文件里用对应TDDFT激发态计算的关键词（写上TD），并且settings.ini里的energyterm参数设为TD=，由此要求molclus提取TDDFT算的root指定的态的激发态能量。注意必须用刚刚发布的molclus 1.9.9.7，否则不支持提取TDDFT激发态能量。

seantan521 · 发表于 Post on 2021-11-24 16:37:12

sobereva 发表于 2021-11-23 10:04
用molclus做激基复合物和做基态复合物搜索的差别，仅在于对于前者需要在模板文件里用对应TDDFT激发态计算的 ...

感谢sob老师的解答，对于第一个问题，我了解了。针对第二个问题，如果molclus是提取TDDFT算root指定的激发态能量的话，那我在导入之前有必要对每种分子做基态或激发态优化么？

sobereva · 发表于 Post on 2021-11-25 10:19:03

seantan521 发表于 2021-11-24 16:37
感谢sob老师的解答，对于第一个问题，我了解了。针对第二个问题，如果molclus是提取TDDFT算root指定的激 ...

通常不用
本身优化不同结构的复合物的时候，里面的单体的构象也会自发改变

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