求助优化木质素磺酸钠在矿物表面吸附时不收敛

125 · 发表于 Post on 2021-12-6 11:45:08

各位老师好，我构建了木质素磺酸钠在黄铁矿表面的吸附模型，如图1所示，在进行结构优化时，一直不收敛，不知道是计算方法的问题还是初始构型搭建的有问题，请老师帮忙看看，感谢！

Eudaimonia · 发表于 Post on 2021-12-6 15:37:13

1.带磁性的体系应该要开自旋极化
2.DFT-D的数值手动设置了么
3.做过表面弛豫吗，弛豫的时候是否收敛了

125 · 发表于 Post on 2021-12-6 16:59:06

本帖最后由 125 于 2021-12-6 17:13 编辑

Eudaimonia 发表于 2021-12-6 15:37
1.带磁性的体系应该要开自旋极化
2.DFT-D的数值手动设置了么
3.做过表面弛豫吗，弛豫的时候是否收敛了

DFT-D参数采用的默认的。请问表面弛豫是指对黄铁矿进行结构优化吗？优化的时候收敛了

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-7 00:16:30

实验是用木质素磺酸钠的水溶液做的吸附吗？水分子在黄铁矿表面可能有化学吸附，得考虑。
此外钠盐比较亲水，除非你研究的是吸附以后高温干燥以后的情况，否则钠应该有配位水。

125 · 发表于 Post on 2021-12-7 11:13:36

wzkchem5 发表于 2021-12-7 00:16
实验是用木质素磺酸钠的水溶液做的吸附吗？水分子在黄铁矿表面可能有化学吸附，得考虑。
此外钠盐比较亲水 ...

是的，在水溶液中的吸附。想模拟一下木质素磺酸钠的吸附对黄铁矿表面亲水性的影响。请问在模拟吸附的时候钠的配位水该如何考虑进去呢？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-12-7 15:50:26

125 发表于 2021-12-7 04:13
是的，在水溶液中的吸附。想模拟一下木质素磺酸钠的吸附对黄铁矿表面亲水性的影响。请问在模拟吸附的时候 ...

如果不仅样品制备在水里，要研究的过程也在水里发生的话，应该把黄铁矿表面铺一层水分子，并且用隐式溶剂模型描述更远处的水。铺上水分子以后做一个构型搜索，这样钠离子就会自动找到合适数量的水分子和它配位

125 · 发表于 Post on 2021-12-7 22:27:14

wzkchem5 发表于 2021-12-7 15:50
如果不仅样品制备在水里，要研究的过程也在水里发生的话，应该把黄铁矿表面铺一层水分子，并且用隐式溶剂 ...

明白了，非常感谢！

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