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[GROMACS] 请教计算蛋白质的回旋半径产生的TM.xvg文件的内容

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您好!
我用gromacs的
gmx_mpi gyrate -f ../all_part3.trr -s ../proteinonly.tpr -o TM.xvg -n gy.ndx  命令计算了一个离子通道蛋白的回旋半径,产生了一个TM.xvg文件,内容如下:
想请教一下,TM.xvg文件的第二、三、四、五列数据代表什么含义?是怎么计算得到的?第二列数值和三、四、五列有数据上的关联吗?
非常感谢您的帮助!

@    title "Radius of gyration (total and around axes)"
@    xaxis  label "Time (ps)"
@    yaxis  label "Rg (nm)"
@TYPE xy
@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85
@ legend on
@ legend box on
@ legend loctype view
@ legend 0.78, 0.8
@ legend length 2
@ s0 legend "Rg"
@ s1 legend "Rg\sX\N"
@ s2 legend "Rg\sY\N"
@ s3 legend "Rg\sZ\N"
           0     2.98936     2.27953     2.26144     2.74994
      1000     3.02309     2.31773     2.27246     2.78248
      2000     3.04117     2.31712      2.2939     2.80472
      3000     3.05499      2.3275     2.30402     2.81783
      4000     3.04866     2.31864     2.30221      2.8129
      5000     3.06207     2.32145     2.31831     2.82647
      6000     3.06182     2.33805     2.29891     2.82807


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发表于 Post on 2022-1-8 06:04:53 | 只看该作者 Only view this author
用grace基于xvg文件作图出来(带着-nxy选项同时绘制所有数据),一看图例便知






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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-8 08:58:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-1-8 06:04
用grace基于xvg文件作图出来(带着-nxy选项同时绘制所有数据),一看图例便知

谢谢卢老师的答复!

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